Agriterra heeft een bestuur op afstand dat wordt gevormd door de vier sectoren die Agriterra dragen. Dit zijn de LTO-organisaties, de plattelandsvrouwen verenigd in de Stichting Samenwerkende Vrouwenorganisaties (SSVO), de Nationale Coöperatieve Raad voor land- en tuinbouw (NCR) en het Nederlands Agrarisch Jongeren Kontakt (NAJK).